Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vmn2r78K7N6U5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn2r78K7N6U5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn2r78K7N6U5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn2r78K7N6U5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn2r78K7N6U5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vmn2r78K7N6U5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn2r78K7N6U5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn2r78K7N6U5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn2r78K7N6U5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms