Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20795J3QP49 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20795J3QP49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm20795J3QP49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20795J3QP49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20795J3QP49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20795J3QP49 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20795J3QP49 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20795J3QP49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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