Protein–RNA interactions for Protein: J3QNQ5

Btbd35f24, BTB domain-containing 35, family member 24, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f24J3QNQ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Btbd35f24J3QNQ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Btbd35f24J3QNQ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Btbd35f24J3QNQ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Btbd35f24J3QNQ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Btbd35f24J3QNQ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms