Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp2b1G5E829 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp2b1G5E829 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp2b1G5E829 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp2b1G5E829 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp2b1G5E829 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp2b1G5E829 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp2b1G5E829 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms