Protein–RNA interactions for Protein: G3X9P9

AF366264, MCG1048453, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AF366264G3X9P9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AF366264G3X9P9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AF366264G3X9P9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AF366264G3X9P9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AF366264G3X9P9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AF366264G3X9P9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AF366264G3X9P9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AF366264G3X9P9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms