Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r39G3UWE6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vmn1r39G3UWE6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r39G3UWE6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r39G3UWE6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r39G3UWE6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r39G3UWE6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r39G3UWE6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms