Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3371F7CQW8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3371F7CQW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm3371F7CQW8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm3371F7CQW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm3371F7CQW8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm3371F7CQW8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm3371F7CQW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3371F7CQW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm3371F7CQW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms