Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp988F6VKC7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp988F6VKC7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp988F6VKC7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp988F6VKC7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp988F6VKC7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp988F6VKC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp988F6VKC7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp988F6VKC7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms