Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh16f1E9Q9P8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh16f1E9Q9P8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh16f1E9Q9P8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh16f1E9Q9P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rdh16f1E9Q9P8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms