Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r48E9Q5D8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r48E9Q5D8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vmn2r48E9Q5D8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r48E9Q5D8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r48E9Q5D8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r48E9Q5D8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms