Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r238E9Q373 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r238E9Q373 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r238E9Q373 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r238E9Q373 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r238E9Q373 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r238E9Q373 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r238E9Q373 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r238E9Q373 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms