Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Scaf11E9PZM7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Scaf11E9PZM7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Scaf11E9PZM7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Scaf11E9PZM7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Scaf11E9PZM7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Scaf11E9PZM7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Scaf11E9PZM7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Scaf11E9PZM7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Scaf11E9PZM7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Scaf11E9PZM7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Scaf11E9PZM7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Scaf11E9PZM7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Scaf11E9PZM7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Scaf11E9PZM7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Scaf11E9PZM7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Scaf11E9PZM7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Scaf11E9PZM7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Scaf11E9PZM7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Scaf11E9PZM7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Scaf11E9PZM7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Scaf11E9PZM7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Scaf11E9PZM7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Scaf11E9PZM7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Scaf11E9PZM7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Scaf11E9PZM7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Scaf11E9PZM7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Scaf11E9PZM7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Scaf11E9PZM7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Scaf11E9PZM7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Scaf11E9PZM7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Scaf11E9PZM7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Scaf11E9PZM7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Scaf11E9PZM7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Scaf11E9PZM7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Scaf11E9PZM7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Scaf11E9PZM7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Scaf11E9PZM7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Scaf11E9PZM7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Scaf11E9PZM7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Scaf11E9PZM7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Scaf11E9PZM7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Scaf11E9PZM7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Scaf11E9PZM7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Scaf11E9PZM7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Scaf11E9PZM7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms