Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ7

Gm20458, Predicted gene 20458, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20458E9PXJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20458E9PXJ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20458E9PXJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20458E9PXJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20458E9PXJ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20458E9PXJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20458E9PXJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20458E9PXJ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms