Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200bD3Z0P8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem200bD3Z0P8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem200bD3Z0P8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200bD3Z0P8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200bD3Z0P8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200bD3Z0P8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms