Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn24D3YXJ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn24D3YXJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn24D3YXJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn24D3YXJ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn24D3YXJ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn24D3YXJ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn24D3YXJ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn24D3YXJ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn24D3YXJ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn24D3YXJ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn24D3YXJ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn24D3YXJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn24D3YXJ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn24D3YXJ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn24D3YXJ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn24D3YXJ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn24D3YXJ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn24D3YXJ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn24D3YXJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn24D3YXJ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms