Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm1141B9EJU1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm1141B9EJU1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm1141B9EJU1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm1141B9EJU1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm1141B9EJU1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm1141B9EJU1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm1141B9EJU1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm1141B9EJU1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm1141B9EJU1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm1141B9EJU1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms