Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp26c1B2RXA7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp26c1B2RXA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cyp26c1B2RXA7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp26c1B2RXA7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp26c1B2RXA7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cyp26c1B2RXA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp26c1B2RXA7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp26c1B2RXA7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms