Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Uhrf1bp1B2KF50 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,81
Uhrf1bp1B2KF50 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Uhrf1bp1B2KF50 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Uhrf1bp1B2KF50 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Uhrf1bp1B2KF50 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Uhrf1bp1B2KF50 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Uhrf1bp1B2KF50 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Uhrf1bp1B2KF50 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Uhrf1bp1B2KF50 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Uhrf1bp1B2KF50 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Uhrf1bp1B2KF50 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Uhrf1bp1B2KF50 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Uhrf1bp1B2KF50 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Uhrf1bp1B2KF50 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Uhrf1bp1B2KF50 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32,38■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32,32■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Uhrf1bp1B2KF50 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Uhrf1bp1B2KF50 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Uhrf1bp1B2KF50 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Uhrf1bp1B2KF50 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Uhrf1bp1B2KF50 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Uhrf1bp1B2KF50 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Uhrf1bp1B2KF50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Uhrf1bp1B2KF50 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Uhrf1bp1B2KF50 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Uhrf1bp1B2KF50 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Uhrf1bp1B2KF50 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Uhrf1bp1B2KF50 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Uhrf1bp1B2KF50 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Uhrf1bp1B2KF50 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32,11■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Uhrf1bp1B2KF50 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32,02■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Uhrf1bp1B2KF50 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms