Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gbp4A4UUI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gbp4A4UUI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gbp4A4UUI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gbp4A4UUI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gbp4A4UUI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gbp4A4UUI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp4A4UUI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms