Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Fbxl16A2RT62 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Fbxl16A2RT62 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Fbxl16A2RT62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Fbxl16A2RT62 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Fbxl16A2RT62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Fbxl16A2RT62 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Fbxl16A2RT62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Fbxl16A2RT62 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Fbxl16A2RT62 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms