Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc43a3A2AVZ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc43a3A2AVZ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc43a3A2AVZ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc43a3A2AVZ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc43a3A2AVZ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc43a3A2AVZ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc43a3A2AVZ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms