Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,52■■□□□ 1,52
CerklA2AQH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,5■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,47■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
CerklA2AQH1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,44■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
CerklA2AQH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,39■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24,39■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24,39■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
CerklA2AQH1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24,32■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
CerklA2AQH1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
CerklA2AQH1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
CerklA2AQH1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24,11■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
CerklA2AQH1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms