Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r2A2AMT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vmn1r2A2AMT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r2A2AMT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r2A2AMT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r2A2AMT6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r2A2AMT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r2A2AMT6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r2A2AMT6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r2A2AMT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r2A2AMT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r2A2AMT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r2A2AMT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r2A2AMT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r2A2AMT6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms