Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc183A2AJB1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc183A2AJB1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc183A2AJB1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc183A2AJB1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc183A2AJB1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ccdc183A2AJB1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc183A2AJB1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc183A2AJB1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc183A2AJB1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ccdc183A2AJB1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc183A2AJB1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc183A2AJB1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc183A2AJB1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms