Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prdm12A2AJ77 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prdm12A2AJ77 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prdm12A2AJ77 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm12A2AJ77 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm12A2AJ77 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm12A2AJ77 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prdm12A2AJ77 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm12A2AJ77 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm12A2AJ77 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms