Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34dA2AGU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34dA2AGU5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn34dA2AGU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34dA2AGU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34dA2AGU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34dA2AGU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms