Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdl2A2AGA4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl2A2AGA4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rhbdl2A2AGA4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhbdl2A2AGA4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhbdl2A2AGA4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhbdl2A2AGA4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhbdl2A2AGA4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms