Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rbbp8nlA2ABX0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rbbp8nlA2ABX0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rbbp8nlA2ABX0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Rbbp8nlA2ABX0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rbbp8nlA2ABX0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rbbp8nlA2ABX0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rbbp8nlA2ABX0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms