Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3pxd2bA2AAY5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3pxd2bA2AAY5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3pxd2bA2AAY5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3pxd2bA2AAY5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3pxd2bA2AAY5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3pxd2bA2AAY5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3pxd2bA2AAY5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.3 ms