Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef6A2A8M8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef6A2A8M8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pramef6A2A8M8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef6A2A8M8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef6A2A8M8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef6A2A8M8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef6A2A8M8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms