Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LII9

Gm45015, Predicted gene 45015, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45015A0A140LII9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Gm45015A0A140LII9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm45015A0A140LII9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm45015A0A140LII9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm45015A0A140LII9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm45015A0A140LII9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm45015A0A140LII9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm45015A0A140LII9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm45015A0A140LII9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm45015A0A140LII9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm45015A0A140LII9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm45015A0A140LII9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm45015A0A140LII9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gm45015A0A140LII9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gm45015A0A140LII9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm45015A0A140LII9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms