Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ighv1-18A0A0A6YXN4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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