Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trbc2A0A075B5J4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trbc2A0A075B5J4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trbc2A0A075B5J4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trbc2A0A075B5J4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbc2A0A075B5J4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trbc2A0A075B5J4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbc2A0A075B5J4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trbc2A0A075B5J4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbc2A0A075B5J4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trbc2A0A075B5J4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trbc2A0A075B5J4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trbc2A0A075B5J4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trbc2A0A075B5J4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms