Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms