Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Irx1P81068 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms