Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 4933432K03Rik-203ENSMUST00000206276 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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