Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Col5a3Q9JLI2 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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Col5a3Q9JLI2 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms