Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
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Traf3ip1Q149C2 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms