Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rb1cc1Q9ESK9 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms