Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Csmd1Q923L3 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms