Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms