Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Hnrnph2-204ENSMUST00000113202 3988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Phc3-202ENSMUST00000064718 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dkc1-201ENSMUST00000033776 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd9P28357 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms