Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col4a6B1AVK5 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms