Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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OtofQ9ESF1 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
OtofQ9ESF1 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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