Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rps29P62274 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms