Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms