Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tulp1Q9Z273 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tulp1Q9Z273 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tulp1Q9Z273 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms