Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn7Q9Z261 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn7Q9Z261 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn7Q9Z261 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms