Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trip6Q9Z1Y4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms