Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hmg20bQ9Z104 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmg20bQ9Z104 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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